Белковая языковая модель RoFormer для извлечения признаков и заполнения пропусков в аминокислотных последовательностях.
Как модель справилась с задачами пользователей ailist и что о ней публикуют открытые лидерборды
Из открытых лидербордов. Сравнивайте результаты одного теста при одинаковых условиях — отсутствие оценки не значит, что модель хуже.
В подключённых источниках результатов для этой модели пока нет.
Описание составлено по карточке модели и метаданным Hugging Face
AI4Protein/deep_bpe_1600 — белковая языковая модель на архитектуре RoFormer, используемая в платформе VenusFactory. Модель разработана для извлечения признаков из аминокислотных последовательностей и также поддерживает задачу заполнения пропусков в последовательности.
Модель содержит 114,5 млн параметров, работает с контекстом до 1026 токенов и доступна в форматах PyTorch и Safetensors. Её можно применять для получения представлений белковых последовательностей и анализа последовательностей с замаскированными позициями. Лицензия — MIT.
Описание не уточняет ограничения качества или конкретные биологические задачи, для которых модель проверялась; длинные последовательности могут превышать указанный контекст.
Карточка не приводит оценок качества и не описывает проверенные биологические сценарии; последовательности длиннее контекста в 1026 токенов могут обрабатываться не полностью.
Разделы каталога профессий, в задачах которых используется эта модель
README от автора на Hugging Face, как он его опубликовал
This model is a RoFormer-based protein language model used within the VenusFactory platform, as described in VenusFactory: A Unified Platform for Protein Engineering Data Retrieval and Language Model Fine-Tuning. It's designed for feature extraction tasks related to protein sequences.
For more details on VenusFactory and its capabilities, please refer to the project's GitHub repository.
На своей GPU в ailist. Цена — по текущим предложениям провайдеров
GPU в ailist
Универсальный рантайм · transformers · fill-mask
Подбираем GPU…