/ Модель

Характеристики

Параметры
41,3 млн
Архитектура
caduceus · dense
Библиотека
transformers
Опубликована
11 июл 2026

BatatasLM-SP5-20L

Заполнение пропусковТекст → текст

Предобученная модель Caduceus для представления и маскированного языкового моделирования последовательностей ДНК сладкого картофеля.

12скачиваний за 30 дней0лайковвеса обновлены11 июл 2026

Бенчмарки

Как модель справилась с задачами пользователей ailist и что о ней публикуют открытые лидерборды

Публичные оценки

Из открытых лидербордов. Сравнивайте результаты одного теста при одинаковых условиях — отсутствие оценки не значит, что модель хуже.

В подключённых источниках результатов для этой модели пока нет.

Что умеет модель

Описание составлено по карточке модели и метаданным Hugging Face

BatatasLM-SP5-20L — предобученная ДНК-модель проекта BatatasLM, разработанная с использованием пяти геномов или образцов сладкого картофеля. Она предназначена для представления последовательностей ДНК и рабочих процессов маскированного языкового моделирования: модель типа Caduceus с архитектурой CaduceusForMaskedLM содержит 41,3 млн параметров и обрабатывает последовательности длиной до 4096 пар оснований. Для загрузки используются Transformers и PyTorch; в репозитории есть пользовательские модули, на которые ссылается auto_map.

Модель подходит для исследовательского анализа последовательностей сладкого картофеля и задач предсказания замаскированных участков ДНК. Карточка не приводит результатов бенчмарков или оценок качества, поэтому пригодность для конкретных задач требует проверки. Лицензия в предоставленных данных не указана.

Сценарии применения

  • предсказание замаскированных участков ДНК
  • получение представлений последовательностей генома сладкого картофеля
  • анализ последовательностей ДНК в исследовательских ML-процессах

Ограничения

Карточка не приводит метрик бенчмарков или оценки производительности. Для загрузки могут потребоваться пользовательские модули из репозитория; условия лицензии в предоставленных данных не описаны.

Карточка модели

README от автора на Hugging Face, как он его опубликовал

Открыть на Hugging Face

BatatasLM-SP5-20L_pretrain

Model Description

BatatasLM pretrained DNA foundation model: BatatasLM-SP5-20L_pretrain.

Model Architecture

The configuration declares model_type caduceus and CaduceusForMaskedLM. Caduceus, Mamba, RCPS, architectures, auto_map, Python module names, and class names are technical identifiers retained for loading.

Training Data

This model uses BatatasLM-SP5-Pretraining-Data, five sweetpotato genomes or accessions. Sequence length is 4096 bp.

Intended Use

Research involving DNA sequence representation and masked-language-modeling workflows.

Model Files

Configuration, pytorch_model.bin, tokenizer files, and custom Python modules referenced by auto_map.

Loading the Model

from transformers import AutoModelForMaskedLM
model = AutoModelForMaskedLM.from_pretrained("BatatasLM-SP5-20L_pretrain", trust_remote_code=True)

Limitations

This card does not assert publication status, benchmark metrics, or a performance conclusion.

Citation

BatatasLM: A Sweetpotato-Centric DNA Foundation Model.

Project Information

Contact

Yiliang Wei - weiyiliang.2013@tsinghua.org.cn

Как запустить

На своей GPU в ailist. Цена — по текущим предложениям провайдеров

GPU в ailist

Универсальный рантайм · transformers · fill-mask

Нельзя запустить

Модели нужен код из репозитория; автор пока не в списке доверенных организаций.

Класс архитектуры
CaduceusForMaskedLM
Ревизия весов
a423532

0 моделей