genomics-tf-prediction

Genereux-akotenou/genomics-tf-prediction — набор моделей машинного обучения, опубликованный Genereux Akotenou и связанный с проектом MegaPlantTF. Он предназначен для выявления и классификации факторов транскрипции растений по белковым последовательностям, включая определение принадлежности к семействам. В проекте используются бинарные классификаторы по семействам и метаклассификатор; модели загружаются через Keras и представлены в формате TensorFlow. MegaPlantTF описывает извлечение признаков на основе k-меров и варианты классификации с голосованием или двухэтапным стекингом.

Модель принимает табличные признаки, подготовленные в рамках соответствующего конвейера, и выдаёт классы; исходная система позволяет подавать белковые последовательности в FASTA. Она рассчитана на биоинформатические задачи для растений, а не на свободный текст. Карточка модели не сообщает размер сети, длину контекста, языки или лицензию; условия лицензирования набора весов из доступных сведений определить нельзя.