/ Модель

Характеристики

Контекст
512 токенов
Параметры
137 млн
Лицензия
Apache 2.0
Архитектура
bert · dense
Библиотека
transformers
Опубликована
4 авг 2026

CeLLaTe-ner-2class-pubmedbert-tapt-combData-tokenizer-original-wwmask

Разметка токеновТекст → label

BERT-модель для извлечения сущностей из англоязычных биомедицинских текстов с помощью токенной классификации.

22скачиваний за 30 дней0лайковвеса обновлены4 авг 2026

Бенчмарки

Как модель справилась с задачами пользователей ailist и что о ней публикуют открытые лидерборды

Публичные оценки

Из открытых лидербордов. Сравнивайте результаты одного теста при одинаковых условиях — отсутствие оценки не значит, что модель хуже.

В подключённых источниках результатов для этой модели пока нет.

Что умеет модель

Описание составлено по карточке модели и метаданным Hugging Face

CeLLaTe-ner-2class-pubmedbert-tapt-combData-tokenizer-original-wwmask — модель распознавания именованных сущностей на основе BERT, разработанная Mardiyyah. Она дообучена от Mardiyyah/CeLLaTe-tapt-pubmedbert-tokenizer-original-wwmask-combinedData на наборе OTAR3088/CeLLaTe-ner-2class-iob_final и предназначена для присвоения меток отдельным токенам текста. Модель содержит 136,7 млн параметров, работает с контекстом до 512 токенов и распространяется в формате safetensors через Transformers.

Модель ориентирована на извлечение сущностей из англоязычных биомедицинских текстов. На указанном в карточке наборе оценки она показала micro F1 0,7601 и accuracy 0,9837; эти результаты характеризуют только конкретный набор и протокол оценки. Карточка не раскрывает классы сущностей и не описывает дополнительные сценарии. Лицензия — Apache-2.0.

Сценарии применения

  • извлечение сущностей из научных статей по биомедицине
  • разметка токенов в англоязычных текстах PubMed
  • автоматическое тегирование сущностей в биомедицинских корпусах

Ограничения

На наборе оценки указаны micro F1 0,7601 и recall 0,7425, поэтому модель может пропускать сущности и ошибаться при их разметке. Карточка не сообщает, какие именно классы сущностей поддерживаются; перенос на другие домены и наборы данных не подтверждён.

Карточка модели

README от автора на Hugging Face, как он его опубликовал

Открыть на Hugging Face

CeLLaTe-ner-2class-pubmedbert-tapt-combData-tokenizer-original-wwmask

This model is a fine-tuned version of Mardiyyah/CeLLaTe-tapt-pubmedbert-tokenizer-original-wwmask-combinedData on the OTAR3088/CeLLaTe-ner-2class-iob_final dataset. It achieves the following results on the evaluation set:

  • Loss: 0.0575
  • Precision: 0.7786
  • Recall: 0.7425
  • Micro F1: 0.7601
  • Weighted F1: 0.7604
  • Macro F1: 0.7695
  • Accuracy: 0.9837

Model description

More information needed

Intended uses & limitations

More information needed

Training and evaluation data

More information needed

Training procedure

Training hyperparameters

The following hyperparameters were used during training:

  • learning_rate: 2e-05
  • train_batch_size: 16
  • eval_batch_size: 16
  • seed: 3407
  • gradient_accumulation_steps: 2
  • total_train_batch_size: 32
  • optimizer: Use OptimizerNames.ADAMW_TORCH with betas=(0.9,0.999) and epsilon=1e-08 and optimizer_args=No additional optimizer arguments
  • lr_scheduler_type: linear
  • lr_scheduler_warmup_ratio: 0.01
  • num_epochs: 20
  • mixed_precision_training: Native AMP

Training results

Training LossEpochStepValidation LossPrecisionRecallMicro F1Weighted F1Macro F1Accuracy
0.25191.02630.05640.67250.73280.70130.70360.72200.9819
0.04042.05260.05390.77580.72000.74680.74710.75810.9835
0.02663.07890.05720.77860.74250.76010.76040.76950.9837
0.01964.010520.06130.75730.74620.75170.75210.76050.9841
0.01475.013150.06990.79330.72610.75820.75820.76210.9838
0.01196.015780.07400.73950.69800.71810.71810.71580.9825

Framework versions

  • Transformers 4.48.2
  • Pytorch 2.4.1+cu121
  • Datasets 3.0.2
  • Tokenizers 0.21.0

Как запустить

На своей GPU в ailist. Цена — по текущим предложениям провайдеров

GPU в ailist

Универсальный рантайм · transformers · token-classification

Можно запустить

Подбираем GPU…

Класс архитектуры
BertForTokenClassification
Ревизия весов
be1c57e

0 моделей