/ Модель

Характеристики

Контекст
512 токенов
Параметры
40 млн
Архитектура
bert · dense
Базовая модель
bge-small-en-v1.5
Библиотека
sentence-transformers
Опубликована
2 июл 2026

rapha-embed-clinical-v1

ЭмбеддингиТекст → embedding3 профессии

Клиническая модель эмбеддингов на базе BGE-small для семантического поиска и сопоставления медицинских текстов.

99скачиваний за 30 дней0лайковвеса обновлены2 июл 2026

Бенчмарки

Как модель справилась с задачами пользователей ailist и что о ней публикуют открытые лидерборды

Тесты пользователейпока нет

Никто ещё не опубликовал тест этой модели. Соберите бенчмарк из своих задач — результат появится здесь.

  1. Добавьте модель в бенчмарк

    Вместе с другими моделями категории «Эмбеддинги» — сравнение идёт внутри одной категории.

  2. Опишите свои задачи

    Напишите запросы, при необходимости приложите файлы и эталонные ответы.

  3. Запустите и опубликуйте

    Модели ответят на каждую задачу, судья оценит ответы. Опубликованный результат появится на этой странице.

Публичные оценки

Из открытых лидербордов. Сравнивайте результаты одного теста при одинаковых условиях — отсутствие оценки не значит, что модель хуже.

В подключённых источниках результатов для этой модели пока нет.

Что умеет модель

Описание составлено по карточке модели и метаданным Hugging Face

Phora68/rapha-embed-clinical-v1 — текстовая Sentence Transformer модель, дообученная на основе BAAI/bge-small-en-v1.5 для клинического семантического поиска и сопоставления предложений. Она кодирует предложения и абзацы в плотные векторы размерности 384, нормализует их и сравнивает по косинусному сходству. Архитектура включает BERT-трансформер и pooling по CLS-токену; метаданные указывают 40 млн параметров и контекст до 512 токенов, тогда как в README заявлена максимальная длина последовательности 128 токенов.

Модель обучалась на парах клинически связанных и несвязанных текстов с MultipleNegativesRankingLoss. Примеры показывают сопоставление жалоб пациентов с клиническими наблюдениями и выделение тревожных симптомов, поэтому модель подходит для поиска клинически релевантных фрагментов и ранжирования кандидатов. Она принимает и выдаёт текстовые представления через векторные эмбеддинги; базовая BGE-модель англоязычная, а приведённые примеры и описание датасета также на английском.

Модель предназначена для поиска и сравнения текстов, а не для постановки диагноза или генерации медицинских рекомендаций. README не сообщает лицензию; численные результаты приведены только для TripletEvaluator на наборе rapha-val и не подтверждают клиническую безопасность или пригодность для других данных.

Сценарии применения

  • поиск клинических наблюдений по жалобам пациента
  • сопоставление симптомов с релевантными медицинскими описаниями
  • ранжирование фрагментов клинических документов по запросу
  • поиск тревожных симптомов в текстовых записях
  • группировка похожих клинических предложений по эмбеддингам

Ограничения

Модель обучена на англоязычных примерах, поэтому качество для других языков не установлено. Поиск и сходство текстов не являются медицинской диагностикой; оценка приведена только для указанного набора rapha-val, а README и метаданные расходятся по максимальной длине последовательности (128 и 512 токенов).

Для каких профессий подходит3

Разделы каталога профессий, в задачах которых используется эта модель

Все профессии

Карточка модели

README от автора на Hugging Face, как он его опубликовал

Открыть на Hugging Face

SentenceTransformer based on BAAI/bge-small-en-v1.5

This is a sentence-transformers model finetuned from BAAI/bge-small-en-v1.5. It maps sentences & paragraphs to a 384-dimensional dense vector space and can be used for retrieval.

Model Details

Model Description

  • Model Type: Sentence Transformer
  • Base model: BAAI/bge-small-en-v1.5
  • Maximum Sequence Length: 128 tokens
  • Output Dimensionality: 384 dimensions
  • Similarity Function: Cosine Similarity
  • Supported Modality: Text

Model Sources

Full Model Architecture

SentenceTransformer(
  (0): Transformer({'transformer_task': 'feature-extraction', 'modality_config': {'text': {'method': 'forward', 'method_output_name': 'last_hidden_state'}}, 'module_output_name': 'token_embeddings', 'architecture': 'BertModel'})
  (1): Pooling({'embedding_dimension': 384, 'pooling_mode': 'cls', 'include_prompt': True})
  (2): Normalize({})
)

Usage

Direct Usage (Sentence Transformers)

First install the Sentence Transformers library:

pip install -U sentence-transformers

Then you can load this model and run inference.

from sentence_transformers import SentenceTransformer

# Download from the 🤗 Hub
model = SentenceTransformer("sentence_transformers_model_id")
# Run inference
sentences = [
    'my breathing is fast and I feel disoriented',
    'Red flag: tachypnoea + confusion — qSOFA >= 2 — possible sepsis — IMMEDIATE ESCALATION',
    'Patient is anxious and hyperventilating due to health anxiety',
]
embeddings = model.encode(sentences)
print(embeddings.shape)
# [3, 384]

# Get the similarity scores for the embeddings
similarities = model.similarity(embeddings, embeddings)
print(similarities)
# tensor([[1.0000, 0.8755, 0.1384],
#         [0.8755, 1.0000, 0.0772],
#         [0.1384, 0.0772, 1.0000]])

Evaluation

Metrics

Triplet

MetricValue
cosine_accuracy1.0

Training Details

Training Dataset

Unnamed Dataset

  • Size: 132,037 training samples
  • Columns: anchor, positive, and negative
  • Approximate statistics based on the first 100 samples:
    anchorpositivenegative
    typestringstringstring
    modalitytexttexttext
    detailsmin: 5 tokensmean: 16.2 tokensmax: 34 tokensmin: 8 tokensmean: 20.9 tokensmax: 33 tokensmin: 8 tokensmean: 12.62 tokensmax: 19 tokens
  • Samples:
    anchorpositivenegative
    I'm trying to stay calm but I have tremors and I genuinely feel like something is very wrong.Observed: tremors — neurological systemPatient is defensive, resistant to clinical interview
    neck pain so bad I can't look down and light sensitivity tooRed flag: neck stiffness + photophobia + fever — possible meningitis — IMMEDIATE ESCALATIONPatient reports muscle tension in neck from bad posture
    neck pain so bad I can't look down and light sensitivity tooRed flag: neck stiffness + photophobia + fever — possible meningitis — IMMEDIATE ESCALATIONPatient reports muscle tension in neck from bad posture
  • Loss: MultipleNegativesRankingLoss with these parameters:
    {
        "scale": 20.0,
        "similarity_fct": "cos_sim",
        "gather_across_devices": false,
        "directions": [
            "query_to_doc"
        ],
        "partition_mode": "joint",
        "hardness_mode": null,
        "hardness_strength": 0.0
    }
    

Evaluation Dataset

Unnamed Dataset

  • Size: 15,000 evaluation samples
  • Columns: anchor, positive, and negative
  • Approximate statistics based on the first 100 samples:
    anchorpositivenegative
    typestringstringstring
    modalitytexttexttext
    detailsmin: 5 tokensmean: 15.39 tokensmax: 27 tokensmin: 9 tokensmean: 18.62 tokensmax: 33 tokensmin: 7 tokensmean: 12.74 tokensmax: 23 tokens
  • Samples:
    anchorpositivenegative
    I'm on prednisolone 5mg dailyCurrent medication: prednisolone 5mg daily — corticosteroid — for inflammatory conditionPatient is not currently prescribed anything
    Diagnosis recorded: Community-acquired pneumonia — ICD-10 code J18.9Observed: cough, fever, shortness of breath — respiratory/infectious — physician confirmed: Community-acquired pneumoniaObserved: cough — upper respiratory tract infection — self-limiting, no antibiotics
    breast lump.Session start: patient presented with unspecified concern — Minimal communication stylePatient presented: numbness in limbs — respiratory system
  • Loss: MultipleNegativesRankingLoss with these parameters:
    {
        "scale": 20.0,
        "similarity_fct": "cos_sim",
        "gather_across_devices": false,
        "directions": [
            "query_to_doc"
        ],
        "partition_mode": "joint",
        "hardness_mode": null,
        "hardness_strength": 0.0
    }
    

Training Hyperparameters

Non-Default Hyperparameters

  • per_device_train_batch_size: 256
  • learning_rate: 2e-05
  • lr_scheduler_type: cosine
  • warmup_steps: 0.1
  • bf16: True
  • per_device_eval_batch_size: 256
  • load_best_model_at_end: True
  • dataloader_drop_last: True

All Hyperparameters

  • per_device_train_batch_size: 256
  • num_train_epochs: 3
  • max_steps: -1
  • learning_rate: 2e-05
  • lr_scheduler_type: cosine
  • lr_scheduler_kwargs: None
  • warmup_steps: 0.1
  • optim: adamw_torch_fused
  • optim_args: None
  • weight_decay: 0.0
  • adam_beta1: 0.9
  • adam_beta2: 0.999
  • adam_epsilon: 1e-08
  • optim_target_modules: None
  • gradient_accumulation_steps: 1
  • average_tokens_across_devices: True
  • max_grad_norm: 1.0
  • label_smoothing_factor: 0.0
  • bf16: True
  • fp16: False
  • bf16_full_eval: False
  • fp16_full_eval: False
  • tf32: None
  • gradient_checkpointing: False
  • gradient_checkpointing_kwargs: None
  • torch_compile: False
  • torch_compile_backend: None
  • torch_compile_mode: None
  • use_liger_kernel: False
  • liger_kernel_config: None
  • use_cache: False
  • neftune_noise_alpha: None
  • torch_empty_cache_steps: None
  • auto_find_batch_size: False
  • log_on_each_node: True
  • logging_nan_inf_filter: True
  • include_num_input_tokens_seen: no
  • log_level: passive
  • log_level_replica: warning
  • disable_tqdm: False
  • project: huggingface
  • trackio_space_id: None
  • trackio_bucket_id: None
  • trackio_static_space_id: None
  • per_device_eval_batch_size: 256
  • prediction_loss_only: True
  • eval_on_start: False
  • eval_do_concat_batches: True
  • eval_use_gather_object: False
  • eval_accumulation_steps: None
  • include_for_metrics: []
  • batch_eval_metrics: False
  • save_only_model: False
  • save_on_each_node: False
  • enable_jit_checkpoint: False
  • push_to_hub: False
  • hub_private_repo: None
  • hub_model_id: None
  • hub_strategy: every_save
  • hub_always_push: False
  • hub_revision: None
  • load_best_model_at_end: True
  • ignore_data_skip: False
  • restore_callback_states_from_checkpoint: False
  • full_determinism: False
  • seed: 42
  • data_seed: None
  • use_cpu: False
  • accelerator_config: {'split_batches': False, 'dispatch_batches': None, 'even_batches': True, 'use_seedable_sampler': True, 'non_blocking': False, 'gradient_accumulation_kwargs': None}
  • parallelism_config: None
  • dataloader_drop_last: True
  • dataloader_num_workers: 0
  • dataloader_pin_memory: True
  • dataloader_persistent_workers: False
  • dataloader_prefetch_factor: None
  • remove_unused_columns: True
  • label_names: None
  • train_sampling_strategy: random
  • length_column_name: length
  • ddp_find_unused_parameters: None
  • ddp_bucket_cap_mb: None
  • ddp_broadcast_buffers: False
  • ddp_static_graph: None
  • ddp_backend: None
  • ddp_timeout: 1800
  • fsdp: None
  • fsdp_config: None
  • deepspeed: None
  • debug: []
  • skip_memory_metrics: True
  • do_predict: False
  • resume_from_checkpoint: None
  • warmup_ratio: None
  • local_rank: -1
  • prompts: None
  • batch_sampler: batch_sampler
  • multi_dataset_batch_sampler: proportional
  • router_mapping: {}
  • learning_rate_mapping: {}

Training Logs

EpochStepTraining LossValidation Lossrapha-val_cosine_accuracy
0.0971503.5863--
0.19421002.3320--
0.29131501.7194--
0.38832001.5596--
0.48542501.4893--
0.58253001.4520--
0.67963501.4428--
0.77674001.4143--
0.87384501.4227--
0.97095001.39911.48931.0
1.06805501.3811--
1.16506001.3818--
1.26216501.3876--
1.35927001.3830--
1.45637501.3690--
1.55348001.3927--
1.65058501.3683--
1.74769001.3772--
1.84479501.3812--
1.941710001.40341.48361.0
2.038810501.3812--
2.135911001.3562--
2.233011501.3676--
2.330112001.3813--
2.427212501.3849--
2.524313001.3729--
2.621413501.3770--
2.718414001.3665--
2.815514501.3469--
2.912615001.37901.47791.0
3.01545-1.47791.0
  • The bold row denotes the saved checkpoint.

Training Time

  • Training: 6.3 minutes

Framework Versions

  • Python: 3.12.13
  • Sentence Transformers: 5.6.0
  • Transformers: 5.12.1
  • PyTorch: 2.11.0+cu128
  • Accelerate: 1.14.0
  • Datasets: 4.0.0
  • Tokenizers: 0.22.2

Citation

BibTeX

Sentence Transformers

@inproceedings{reimers-2019-sentence-bert,
    title = "Sentence-BERT: Sentence Embeddings using Siamese BERT-Networks",
    author = "Reimers, Nils and Gurevych, Iryna",
    booktitle = "Proceedings of the 2019 Conference on Empirical Methods in Natural Language Processing",
    month = "11",
    year = "2019",
    publisher = "Association for Computational Linguistics",
    url = "https://arxiv.org/abs/1908.10084",
}

MultipleNegativesRankingLoss

@misc{oord2019representationlearningcontrastivepredictive,
      title={Representation Learning with Contrastive Predictive Coding},
      author={Aaron van den Oord and Yazhe Li and Oriol Vinyals},
      year={2019},
      eprint={1807.03748},
      archivePrefix={arXiv},
      primaryClass={cs.LG},
      url={https://arxiv.org/abs/1807.03748},
}

Как запустить

На своей GPU в ailist. Цена — по текущим предложениям провайдеров

GPU в ailist

Универсальный рантайм · sentence-transformers

Можно запустить

Подбираем GPU…

Класс архитектуры
BertModel
Ревизия весов
4927cad

0 моделей