BioBERT model fine-tuned in NER task with BC5CDR-diseases and NCBI-diseases corpus
This was fine-tuned in order to use it in a BioNER/BioNEN system which is available at: https://github.com/librairy/bio-ner
Характеристики
- Контекст
- 512 токенов
- Параметры
- 136 млн
- Лицензия
- Apache 2.0
- Архитектура
- bert · dense
- Опубликована
- 2 мар 2022
Ссылки
biobert_diseases_ner
BioBERT, дообученная для выявления упоминаний заболеваний в биомедицинских текстах.
12 617скачиваний за 30 дней48лайковвеса обновлены17 мар 2023
Бенчмарки
Как модель справилась с задачами пользователей ailist и что о ней публикуют открытые лидерборды
Публичные оценки
Из открытых лидербордов. Сравнивайте результаты одного теста при одинаковых условиях — отсутствие оценки не значит, что модель хуже.
В подключённых источниках результатов для этой модели пока нет.
Что умеет модель
Описание составлено по карточке модели и метаданным Hugging Face
alvaroalon2/biobert_diseases_ner — модель BioBERT, дообученная для распознавания заболеваний в биомедицинских текстах. Она предназначена для извлечения упоминаний заболеваний в системах распознавания и нормализации биомедицинских сущностей (BioNER/BioNEN).
Сценарии применения
- извлечение названий заболеваний из научных статей
- поиск заболеваний в биомедицинских документах
- разметка упоминаний болезней в текстах для BioNER
- подготовка текстов для нормализации биомедицинских сущностей
Ограничения
Модель рассчитана на распознавание заболеваний в биомедицинских текстах и не является универсальной моделью для клинических решений. Контекст ограничен 512 токенами.
Для каких профессий подходит3
Разделы каталога профессий, в задачах которых используется эта модель
I.3Универсальные способностиИзвлечение и структурирование данныхAI помогает превращать разрозненные данные в структуру, пригодную для поиска, аналитики и автоматизации.18 задач25 791модельIV.4Отраслевые задачиКлиническая медицина и общественное здоровьеAI помогает поддерживать диагностику, лечение, наблюдение и организацию медицинской помощи.45 задач2 635моделейI.11Универсальные способностиКлассификация, ранжирование и сопоставлениеAI помогает распределять объекты по категориям, устанавливать соответствия и определять порядок обработки.15 задач26 736моделей
Карточка модели
README от автора на Hugging Face, как он его опубликовал
Как запустить
На своей GPU в ailist. Цена — по текущим предложениям провайдеров
GPU в ailist
Универсальный рантайм · token-classification
Подбираем GPU…
- Класс архитектуры
- BertForTokenClassification
- Ревизия весов
- 0a4ed7d