/ Модель

Характеристики

Контекст
1 026 токенов
Параметры
865 млн
Архитектура
esm · dense
Опубликована
17 окт 2022

esm1v_t33_650M_UR90S_1

Заполнение пропусковТекст → текст3 профессии

ESM-1v — предобученная белковая языковая модель Meta AI для оценки функционального эффекта вариантов белковых последовательностей.

12 921скачиваний за 30 дней5лайковвеса обновлены16 ноя 2022

Бенчмарки

Как модель справилась с задачами пользователей ailist и что о ней публикуют открытые лидерборды

Публичные оценки

Из открытых лидербордов. Сравнивайте результаты одного теста при одинаковых условиях — отсутствие оценки не значит, что модель хуже.

В подключённых источниках результатов для этой модели пока нет.

Что умеет модель

Описание составлено по карточке модели и метаданным Hugging Face

ESM-1v t33 650M UR90S_1 — белковая языковая модель, разработанная Meta AI (Facebook Research). Она предназначена прежде всего для предсказания функциональных эффектов вариантов белковых последовательностей, в том числе без дополнительного обучения, по оценке различий правдоподобия последовательностей. Модель использует 33-слойный трансформер ESM-1b и обучена на последовательностях UniRef90; это первая из пяти моделей ансамбля ESM-1v. Метаданные Hugging Face указывают около 865 млн параметров и контекст до 1026 токенов; репозиторий содержит веса PyTorch и TensorFlow.

Модель принимает аминокислотные последовательности с замаскированными токенами и предсказывает вероятности аминокислот для заполнения маски. Её можно применять для ранжирования мутаций по ожидаемому влиянию на функцию белка и для вычисления представлений белковых последовательностей. Она не генерирует структуру белка напрямую: для этого нужны другие модели или отдельные методы. Модель выпущена как предобученная исследовательская модель; доступность лицензии следует проверять в карточке репозитория перед использованием.

Сценарии применения

  • Оценка влияния аминокислотной замены на функцию белка
  • Ранжирование вариантов белка по вероятному функциональному эффекту
  • Сравнение исходной и мутировавшей белковых последовательностей
  • Заполнение маски аминокислот в белковой последовательности
  • Получение представлений белковых последовательностей для последующего анализа

Ограничения

Основное назначение модели — оценка эффектов вариантов по последовательностям; она сама по себе не выдает трехмерную структуру белка. Для практического ранжирования вариантов могут потребоваться специальные методы подсчета оценок и сопоставление нескольких моделей ансамбля.

Для каких профессий подходит3

Разделы каталога профессий, в задачах которых используется эта модель

Все профессии

Карточка модели

README от автора на Hugging Face, как он его опубликовал

Открыть на Hugging Face

Автор не опубликовал карточку модели.

Как запустить

На своей GPU в ailist. Цена — по текущим предложениям провайдеров

GPU в ailist

Универсальный рантайм · fill-mask

Можно запустить

Подбираем GPU…

Класс архитектуры
EsmForMaskedLM
Ревизия весов
8bfdb18

0 моделей