Характеристики
- Контекст
- 1 026 токенов
- Параметры
- 865 млн
- Архитектура
- esm · dense
- Опубликована
- 17 окт 2022
Ссылки
esm1v_t33_650M_UR90S_2
ESM-1v — белковая языковая модель Meta AI для оценки эффектов генетических вариантов по аминокислотным последовательностям.
Бенчмарки
Как модель справилась с задачами пользователей ailist и что о ней публикуют открытые лидерборды
Публичные оценки
Из открытых лидербордов. Сравнивайте результаты одного теста при одинаковых условиях — отсутствие оценки не значит, что модель хуже.
В подключённых источниках результатов для этой модели пока нет.
Что умеет модель
Описание составлено по карточке модели и метаданным Hugging Face
ESM-1v — белковая языковая модель, разработанная Facebook AI Research (ныне Meta AI) для оценки эффектов генетических вариантов по аминокислотным последовательностям. Этот чекпойнт — один из пяти вариантов ESM-1v с архитектурой Transformer: 33 слоя, около 865 млн параметров и максимальная длина входа 1026 токенов. Он предсказывает пропущенные аминокислотные токены и может использоваться в методах оценки вариантов, основанных на вероятностях модели. Модель работает с последовательностями белков, а не с естественными языками.
Репозиторий содержит веса PyTorch и TensorFlow и размечен задачей fill-mask. Карточка Hugging Face не содержит сведений о лицензии; ESM-1v опубликована как исследовательская модель для предсказания эффектов вариантов. Модель сама по себе не выдаёт клинический диагноз и её оценки требуют интерпретации в исследовательском контексте.
Сценарии применения
- заполнение пропущенных аминокислот в белковой последовательности
- оценка влияния аминокислотной замены на белок
- ранжирование генетических вариантов по предполагаемому эффекту
- извлечение вероятностей аминокислот для анализа вариантов
Ограничения
Модель оценивает варианты на основе белковых последовательностей, но её предсказания сами по себе не являются клиническими выводами. Карточка Hugging Face не содержит явного указания лицензии.
Для каких профессий подходит3
Разделы каталога профессий, в задачах которых используется эта модель
Карточка модели
README от автора на Hugging Face, как он его опубликовал
Автор не опубликовал карточку модели.
Как запустить
На своей GPU в ailist. Цена — по текущим предложениям провайдеров
GPU в ailist
Универсальный рантайм · fill-mask
Подбираем GPU…
- Класс архитектуры
- EsmForMaskedLM
- Ревизия весов
- 3c1e9e6