Характеристики
- Контекст
- 1 026 токенов
- Параметры
- 865 млн
- Архитектура
- esm · dense
- Опубликована
- 17 окт 2022
Ссылки
esm1v_t33_650M_UR90S_3
ESM-1v — белковая языковая модель Meta AI для оценки влияния аминокислотных вариантов по последовательностям белка.
Бенчмарки
Как модель справилась с задачами пользователей ailist и что о ней публикуют открытые лидерборды
Публичные оценки
Из открытых лидербордов. Сравнивайте результаты одного теста при одинаковых условиях — отсутствие оценки не значит, что модель хуже.
В подключённых источниках результатов для этой модели пока нет.
Что умеет модель
Описание составлено по карточке модели и метаданным Hugging Face
ESM-1v — белковая языковая модель, разработанная исследовательской группой Meta AI и распространяемая в репозитории facebook. Это третий чекпойнт из ансамбля пяти моделей ESM-1v, предназначенного прежде всего для оценки эффектов аминокислотных вариантов. Модель представляет собой 33-слойный Transformer примерно с 650 млн параметров, обученный на последовательностях UniRef90; в Hugging Face она доступна для задачи fill-mask.
Модель принимает последовательности белков и предсказывает вероятности аминокислот в замаскированных позициях. Вариантные эффекты можно оценивать по изменению вероятности последовательности при замене аминокислоты; ансамбль ESM-1v разработан для таких предсказаний без необходимости строить множественное выравнивание последовательностей. Это специализированная модель для белковых последовательностей, а не генеративная модель естественного языка. Карточка Hugging Face не содержит отдельного описания лицензии; в репозитории указаны веса в форматах PyTorch и TensorFlow.
Сценарии применения
- оценка эффекта аминокислотной замены в белке
- ранжирование вариантов белковой последовательности по вероятности
- заполнение замаскированных аминокислот в последовательности
- анализ белковых вариантов без построения множественного выравнивания
Ограничения
Модель специализирована на белковых последовательностях и не предназначена для понимания естественного языка. Это один чекпойнт пяти-модельного ансамбля; карточка Hugging Face не содержит отдельного описания лицензии.
Для каких профессий подходит3
Разделы каталога профессий, в задачах которых используется эта модель
Карточка модели
README от автора на Hugging Face, как он его опубликовал
Автор не опубликовал карточку модели.
Как запустить
На своей GPU в ailist. Цена — по текущим предложениям провайдеров
GPU в ailist
Универсальный рантайм · fill-mask
Подбираем GPU…
- Класс архитектуры
- EsmForMaskedLM
- Ревизия весов
- 0b00fd1