Характеристики
- Контекст
- 1 026 токенов
- Параметры
- 865 млн
- Архитектура
- esm · dense
- Опубликована
- 17 окт 2022
Ссылки
esm1v_t33_650M_UR90S_4
ESM-1v — трансформер Meta AI для предсказания вероятного влияния вариантов аминокислот на белковые последовательности.
Бенчмарки
Как модель справилась с задачами пользователей ailist и что о ней публикуют открытые лидерборды
Публичные оценки
Из открытых лидербордов. Сравнивайте результаты одного теста при одинаковых условиях — отсутствие оценки не значит, что модель хуже.
В подключённых источниках результатов для этой модели пока нет.
Что умеет модель
Описание составлено по карточке модели и метаданным Hugging Face
ESM-1v — белковая языковая модель, разработанная исследовательской группой Meta AI (facebookresearch/esm). Этот чекпойнт входит в серию из пяти моделей, обученных предсказывать эффекты аминокислотных вариантов по белковым последовательностям. Он предназначен для оценки вариантов белка и анализа их вероятного влияния на функцию.
Модель использует архитектуру трансформера ESM с маскированным языковым моделированием: 33 слоя, около 865 млн параметров по метаданным Hugging Face и контекст до 1026 токенов. На вход подаются последовательности аминокислот; модель предсказывает вероятности аминокислот для замаскированных позиций. Это специализированная модель для белковых последовательностей, а не обычный текстовый чат-бот. Репозиторий предоставляет веса PyTorch и TensorFlow. Лицензия в доступных источниках не подтверждена.
Сценарии применения
- оценка вероятного эффекта аминокислотной замены
- сравнение вариантов белковой последовательности
- ранжирование вариантов белка по предсказанному эффекту
- заполнение замаскированных позиций в белковой последовательности
Ограничения
Модель предназначена для белковых последовательностей и не является универсальной языковой моделью. Предсказанные оценки вариантов сами по себе не заменяют экспериментальную проверку.
Для каких профессий подходит3
Разделы каталога профессий, в задачах которых используется эта модель
Карточка модели
README от автора на Hugging Face, как он его опубликовал
Автор не опубликовал карточку модели.
Как запустить
На своей GPU в ailist. Цена — по текущим предложениям провайдеров
GPU в ailist
Универсальный рантайм · fill-mask
Подбираем GPU…
- Класс архитектуры
- EsmForMaskedLM
- Ревизия весов
- 443968f