Модель классифицирует пары последовательностей VH и VL, помогая исследовать предпочтения спаривания тяжёлых и лёгких цепей антител.
Как модель справилась с задачами пользователей ailist и что о ней публикуют открытые лидерборды
Из открытых лидербордов. Сравнивайте результаты одного теста при одинаковых условиях — отсутствие оценки не значит, что модель хуже.
В подключённых источниках результатов для этой модели пока нет.
Описание составлено по карточке модели и метаданным Hugging Face
ImmunoMatch — белковая языковая модель, дообученная Fraternalilab на базе AntiBERTa2-CSSP для изучения предпочтений спаривания тяжёлых и лёгких цепей антител. Она принимает пару аминокислотных последовательностей доменов VH и VL и выполняет классификацию, связанную с их совместимостью. Доступны варианты, обученные на смесях антител с κ- и λ-цепями, а также отдельные варианты для κ- или λ-цепей.
Модель построена на архитектуре RoFormer, содержит около 268,5 млн параметров и рассчитана на контекст до 256 токенов. Репозиторий содержит веса PyTorch; лицензия CC BY-NC 4.0 разрешает использование с указанием авторства, но запрещает коммерческое применение.
Модель предназначена для анализа пар доменов VH и VL; README не описывает метрики качества или обобщение на другие типы белковых последовательностей. Лицензия CC BY-NC 4.0 запрещает коммерческое использование.
Разделы каталога профессий, в задачах которых используется эта модель
README от автора на Hugging Face, как он его опубликовал
ImmunoMatch is a protein language model finetuned from AntiBERTa2, aiming at investigating the heavy and light chain pairing preferences in antibody. The input sequence to the model should be a pair of sequences of VH and VL domains.
Different variants of ImmunoMatch is available according to the use of interest:
| Checkpoint name | Trained on |
|---|---|
| ImmunoMatch | A mixture of antibodies with both κ and λ light chains |
| ImmunoMatch-κ | Antibodies with κ light chains |
| ImmunoMatch-λ | Antibodies with λ light chains |
На своей GPU в ailist. Цена — по текущим предложениям провайдеров
GPU в ailist
Универсальный рантайм · transformers · text-classification
Подбираем GPU…