RoFormer-модель для классификации пар доменов VH и VL и изучения предпочтений спаривания антительных цепей с κ-цепью.
351скачиваний за 30 дней0лайковвеса обновлены21 янв 2025
Бенчмарки
Как модель справилась с задачами пользователей ailist и что о ней публикуют открытые лидерборды
Публичные оценки
Из открытых лидербордов. Сравнивайте результаты одного теста при одинаковых условиях — отсутствие оценки не значит, что модель хуже.
В подключённых источниках результатов для этой модели пока нет.
Что умеет модель
Описание составлено по карточке модели и метаданным Hugging Face
ImmunoMatch-κ — вариант белковой языковой модели ImmunoMatch, дообученный на антителах с κ-цепями. Модель разработана для изучения предпочтений спаривания тяжёлой и лёгкой цепей антител; на вход подают пару аминокислотных последовательностей доменов VH и VL. Это RoFormer-модель для классификации последовательностей с 268,5 млн параметров и контекстом до 256 токенов, основанная на AntiBERTa2-CSSP.
Модель подходит для анализа совместимости пар вариабельных доменов антител и исследований репертуаров антител с κ-цепями. В семействе также представлены контрольные точки для антител с λ-цепями и для смеси антител с κ- и λ-цепями. Опубликована в формате PyTorch; лицензия CC BY-NC 4.0 запрещает коммерческое использование без отдельного разрешения.
Сценарии применения
оценка предпочтений спаривания тяжёлой и лёгкой цепей антител
анализ пар вариабельных доменов VH и VL
исследование антительных репертуаров с κ-цепями
Ограничения
Модель обучена на антителах с κ-цепями, поэтому её назначение ограничено этим типом лёгкой цепи. Контекст составляет 256 токенов; лицензия CC BY-NC 4.0 ограничивает коммерческое использование.
Для каких профессий подходит3
Разделы каталога профессий, в задачах которых используется эта модель
ImmunoMatch-κ is a variant of ImmunoMatch, which is a protein language model finetuned from AntiBERTa2, aiming at investigating the heavy and light chain pairing preferences in antibody. The input to the model should be a pair of sequences of VH and VL domains.
Different variants of ImmunoMatch is available according to the use of interest: