/ Модель

Характеристики

Контекст
256 токенов
Параметры
268 млн
Лицензия
CC BY-NC 4.0
Архитектура
roformer · dense
Базовая модель
antiberta2-cssp
Опубликована
14 янв 2025

immunomatch-lambda

Классификация текстаТекст → label3 профессии

Дообученная на антителах с λ-цепью RoFormer-модель для классификации пар тяжёлых и лёгких цепей антител.

329скачиваний за 30 дней0лайковвеса обновлены21 янв 2025

Бенчмарки

Как модель справилась с задачами пользователей ailist и что о ней публикуют открытые лидерборды

Публичные оценки

Из открытых лидербордов. Сравнивайте результаты одного теста при одинаковых условиях — отсутствие оценки не значит, что модель хуже.

В подключённых источниках результатов для этой модели пока нет.

Что умеет модель

Описание составлено по карточке модели и метаданным Hugging Face

ImmunoMatch-λ — модель Fraternalilab для изучения предпочтений спаривания тяжёлых и лёгких цепей антител. Это вариант ImmunoMatch, дообученный на AntiBERTa2-CSSP и обученный на антителах с лёгкими цепями типа λ. Модель принимает пару аминокислотных последовательностей доменов VH и VL и предназначена для классификации, связанной с совместимостью или предпочтениями спаривания цепей.

Модель построена на RoFormer, содержит 268,5 млн параметров и имеет контекстное окно 256 токенов. Для запуска используются веса PyTorch. Лицензия CC BY-NC 4.0 ограничивает использование некоммерческими целями.

Сценарии применения

  • оценка спаривания доменов VH и VL антител
  • изучение предпочтений спаривания λ-цепей антител
  • классификация пар последовательностей антител в исследовательском анализе

Ограничения

Модель предназначена для пар последовательностей доменов VH и VL и обучена на антителах с λ-цепями; её применимость к κ-цепям не подтверждена. Лицензия CC BY-NC 4.0 допускает только некоммерческое использование.

Для каких профессий подходит3

Разделы каталога профессий, в задачах которых используется эта модель

Все профессии

Карточка модели

README от автора на Hugging Face, как он его опубликовал

Открыть на Hugging Face

ImmunoMatch-λ is a variant of ImmunoMatch, which is a protein language model finetuned from AntiBERTa2, aiming at investigating the heavy and light chain pairing preferences in antibody. The input to the model should be a pair of sequences of VH and VL domains.

Different variants of ImmunoMatch is available according to the use of interest:

Checkpoint nameTrained on
ImmunoMatchA mixture of antibodies with both κ and λ light chains
ImmunoMatch-κAntibodies with κ light chains
ImmunoMatch-λAntibodies with λ light chains

Как запустить

На своей GPU в ailist. Цена — по текущим предложениям провайдеров

GPU в ailist

Универсальный рантайм · text-classification

Можно запустить

Подбираем GPU…

Класс архитектуры
RoFormerForSequenceClassification
Ревизия весов
a01c38e

0 моделей