Сверточная masked language model для восстановления участков ДНК и анализа геномов Arabidopsis thaliana и родственных растений.
Как модель справилась с задачами пользователей ailist и что о ней публикуют открытые лидерборды
Из открытых лидербордов. Сравнивайте результаты одного теста при одинаковых условиях — отсутствие оценки не значит, что модель хуже.
В подключённых источниках результатов для этой модели пока нет.
Описание составлено по карточке модели и метаданным Hugging Face
GPN Brassicales — сверточная языковая модель геномных последовательностей, обученная на Arabidopsis thaliana и ещё семи видах порядка Brassicales. Модель доступна через Transformers как masked language model и предназначена для восстановления замаскированных участков ДНК и анализа геномных последовательностей.
Обучение охватывает Arabidopsis thaliana и ещё семь видов Brassicales, поэтому перенос на другие организмы может быть ограничен. Карточка не описывает метрики качества или проверку предсказания эффектов вариантов.
Разделы каталога профессий, в задачах которых используется эта модель
README от автора на Hugging Face, как он его опубликовал
See https://github.com/songlab-cal/gpn for more details.
Basic usage:
import gpn.model
from transformers import AutoModel, AutoModelForMaskedLM
model = AutoModel.from_pretrained("songlab/gpn-brassicales")
# or
model = AutoModelForMaskedLM.from_pretrained("songlab/gpn-brassicales")
На своей GPU в ailist. Цена — по текущим предложениям провайдеров
GPU в ailist
Универсальный рантайм · fill-mask
Архитектура ConvNet неизвестна transformers в образе рантайма.