MedNER-TR: Turkish Medical Named Entity Recognition
Türkçe klinik ve tıbbi metinlerde ilaç, hastalık, semptom, organ ve tıbbi test adlarını tanıyan BERT tabanlı NER modeli.
Model Özeti
MedNER-TR, Türkçe sağlık metinleri (hasta notları, tıbbi raporlar, reçeteler) üzerinde beş temel tıbbi varlık türünü işaretlemek için dbmdz/bert-base-turkish-cased üzerinden fine-tune edilmiştir. Model, klinik NLP araştırmaları, tıbbi bilgi çıkarımı ve elektronik hasta kaydı analizinde kullanım için tasarlanmıştır.
🚀 Demo
Canlı demo için: tugrulkaya/medner-tr Space — alternatif Gradio demo
Desteklenen Varlıklar
| Etiket | Açıklama | Örnek |
|---|---|---|
ILAC | İlaç adı | Parol, Aspirin |
HASTALIK | Hastalık / tanı | Migren, Diyabet |
SEMPTOM | Semptom / şikayet | Baş ağrısı, Ateş |
ORGAN | Organ / anatomik yapı | Karaciğer, Kalp |
TEST | Tıbbi test / tetkik | MR, Kan testi |
Performans
| Metrik | Değer |
|---|---|
| F1 (micro) | 99.49% |
| Precision | 99.49% |
| Recall | 99.49% |
| Accuracy | 99.76% |
Not: Yüksek skorlar görece küçük ve kontrollü bir test setinden alınmıştır. Gerçek klinik metinlerde performans değişebilir.
Kullanım
from transformers import pipeline
ner = pipeline(
"token-classification",
model="tugrulkaya/medner-tr",
aggregation_strategy="simple",
)
text = "Hastaya Parol 500mg başlandı, baş ağrısı ve ateş şikayeti mevcut."
for ent in ner(text):
print(f"{ent['entity_group']:10s} {ent['word']:20s} {ent['score']:.3f}")
Eğitim Detayları
- Base model:
dbmdz/bert-base-turkish-cased - Dataset: ~2000 el ile etiketlenmiş Türkçe tıbbi cümle
- Epoch: 3
- Optimizer: AdamW
- Max length: 128
Sınırlamalar ve Etik
- Model klinik karar vermek için kullanılmamalıdır. Yalnızca bilgi çıkarımı / araştırma amaçlıdır.
- Eğitim verisi küçük olduğu için nadir hastalıklar veya non-standart terimlerde performans düşebilir.
- Her klinik uygulamada insan denetimi zorunludur.
Lisans
MIT
Atıf
@misc{kaya2025mednertr,
author = {Kaya, Tuğrul},
title = {MedNER-TR: Turkish Medical Named Entity Recognition},
year = {2025},
url = {https://huggingface.co/tugrulkaya/medner-tr}
}