BertAIP

BertAIP — модель на основе BERT, разработанная Jianchao Ying и соавторами для предсказания противовоспалительной активности пептидов. Она классифицирует белковые последовательности и выдаёт оценочную вероятность того, что последовательность является противовоспалительным пептидом, вместе с результатом классификации. Модель использует архитектуру BERT для классификации текста, содержит 136,7 млн параметров и рассчитана на контекст до 512 токенов.

Инструмент принимает последовательности в формате FASTA; согласно документации проекта, длина последовательности не должна превышать 54 аминокислот, а неоднозначные символы и символы-заполнители не допускаются. Модель ориентирована на анализ белковых последовательностей, а не на обычный текст. Hugging Face указывает формат PyTorch; сведения о лицензии в доступных источниках не установлены.