Небольшая модель на базе ESM-2 размечает позиции белковой последовательности, предположительно связывающие РНК.

Подходит для: поиск участков связывания РНК в белковой последовательности · разметка аминокислотных позиций, участвующих во взаимодействии белка с РНК · предварительный анализ кандидатов белок—РНК

Экспериментальный классификатор на базе ESM-2 для отнесения белковых последовательностей к ферментам, рецепторным или структурным белкам.

Подходит для: классификация белковых последовательностей на ферменты, рецепторы и структурные белки · учебные эксперименты с классификацией белковых последовательностей · проверка применимости ESM-2 для группировки белков по типу

Экспериментальный чекпойнт ESM-2 для дальнейшего дообучения многометочной классификации функций белков по последовательности.

Подходит для: дальнейшее дообучение модели для предсказания функций белков · эксперименты с LoRA для классификации аминокислотных последовательностей · исследование предсказания меток Gene Ontology на данных CAFA-5

Предварительно дообученная модель ESM-2 для многометочного предсказания функций белков по терминам Gene Ontology.

Подходит для: предсказание функций белка по аминокислотной последовательности · классификация белковых последовательностей по терминам Gene Ontology · подготовка модели для второго этапа обучения с LoRA

Дообученная ESM-2 классифицирует белковые последовательности как цитозольные или мембранные.

Подходит для: предсказание локализации белка по аминокислотной последовательности · разделение белков на цитозольные и мембранные · автоматическая разметка белковых последовательностей