Базовая нуклеотидная авторегрессионная модель Marin на 1,12 млрд параметров для генерации и исследования коротких последовательностей ДНК.

Подходит для: генерация продолжений коротких последовательностей ДНК · изучение закономерностей в кодирующих и некодирующих участках генома · исследовательские эксперименты с последовательностями энхансеров и ncRNA

Компактная авторегрессионная модель Marin на 45,9 млн параметров для генерации нуклеотидных последовательностей ДНК и экспериментов с геномными данными.

Подходит для: генерация продолжения последовательности ДНК · моделирование коротких нуклеотидных последовательностей · эксперименты с языковыми моделями для геномики

Авторегрессионная модель MarinDNA с 1,12 млрд параметров генерирует продолжения коротких последовательностей ДНК и предназначена для геномных исследований.

Подходит для: генерация продолжений последовательностей ДНК · моделирование локальных геномных последовательностей · исследование кодирующих и регуляторных последовательностей

Небольшая причинная Transformer-модель Marin для генерации последовательностей ДНК по нуклеотидам.

Подходит для: генерация продолжения короткой последовательности ДНК · эксперименты с причинным языковым моделированием нуклеотидов · сравнение качества моделей ДНК разного размера

Компактная модель Meta AI для заполнения пропусков и анализа аминокислотных последовательностей белков.

Подходит для: восстановление пропущенных аминокислот в белковой последовательности · получение представлений белковых последовательностей для последующего анализа · дообучение для предсказания свойств белков

Геномная авторегрессионная модель HyenaDNA для генерации ДНК и анализа длинных последовательностей на уровне отдельных нуклеотидов.

Подходит для: генерация продолжения последовательности ДНК · дообучение классификатора геномных последовательностей · поиск регуляторных элементов в геноме

Minerva-MLM — геномная языковая модель для заполнения масок в последовательностях и анализа коэволюционных сигналов, контактов и повторов.

Подходит для: заполнение замаскированных участков геномной последовательности · поиск сигналов спаривания оснований в РНК · предсказание контактов белка по последовательности

Компактная геномная модель HyenaDNA для предсказания и генерации продолжения последовательностей ДНК на уровне нуклеотидов.

Подходит для: генерация продолжения последовательности ДНК · предсказание следующего нуклеотида в геноме · дообучение модели для классификации геномных последовательностей

Предварительно обученная геномная masked language model InstaDeepAI для восстановления нуклеотидов и анализа последовательностей ДНК.

Подходит для: восстановление замаскированных нуклеотидов в последовательности ДНК · получение представлений геномных последовательностей для последующего анализа · аннотация геномных последовательностей

Компактная геномная языковая модель HyenaDNA для предсказания нуклеотидов и анализа длинных последовательностей ДНК.

Подходит для: генерация продолжения последовательности ДНК · классификация геномных последовательностей после дообучения · предсказание регуляторных элементов

HyenaDNA large-1m — компактная геномная модель для генерации и анализа последовательностей ДНК с контекстом до 1 млн нуклеотидов.

Подходит для: генерация продолжения последовательности ДНК · классификация геномных последовательностей после дообучения · выявление регуляторных элементов в геноме

Компактная геномная языковая модель HyenaDNA для предсказания нуклеотидов и анализа длинных последовательностей ДНК.

Подходит для: предсказание следующего нуклеотида в последовательности ДНК · классификация геномных последовательностей · поиск регуляторных элементов в ДНК

HyenaDNA medium — геномная авторегрессионная модель для предсказания нуклеотидов и анализа длинных последовательностей длиной до 160 тысяч нуклеотидов.

Подходит для: предсказание следующего нуклеотида в геномной последовательности · классификация геномных последовательностей · выявление регуляторных элементов ДНК

Производная модели gbrixi/minerva-mlm. Minerva-MLM — геномная языковая модель для заполнения масок в последовательностях и анализа коэволюционных сигналов, контактов и повторов.

Подходит для: заполнение замаскированных участков геномной последовательности · поиск сигналов спаривания оснований в РНК · предсказание контактов белка по последовательности

GB.DNA-300M — базовая модель RNABert для предсказания замаскированных элементов и построения моделей анализа биологических последовательностей.

Подходит для: предсказание замаскированных нуклеотидов в последовательности · дообучение классификатора биологических последовательностей · классификация отдельных позиций последовательности

Предварительно обученная модель на базе Mixtral для генерации и продолжения последовательностей ДНК человека hg38.

Подходит для: генерация продолжений последовательностей ДНК человека · моделирование фрагментов генома hg38 · эксперименты с языковыми моделями для геномных последовательностей

Биологическая языковая модель StripedHyena для моделирования и генерации нуклеотидных последовательностей с контекстом 8 192 токена.

Подходит для: генерация биологических последовательностей на уровне нуклеотидов · моделирование прокариотических геномных последовательностей · дообучение базовой модели для молекулярных задач

Предобученная авторегрессионная модель Mistral с 4,2 млрд параметров для генерации и анализа последовательностей микробных геномов.

Подходит для: генерация последовательностей ДНК микроорганизмов · анализ геномных последовательностей микробов · исследование микробиомов

Carbon-500M — компактная Llama-подобная авторегрессионная модель для генерации и оценки последовательностей ДНК.

Подходит для: генерация геномных последовательностей ДНК · продолжение заданной последовательности ДНК · оценка вероятности последовательности по нуклеотидам

Carbon-3B — геномная авторегрессионная модель для генерации последовательностей ДНК и РНК и решения связанных задач анализа.

Подходит для: генерация геномных последовательностей ДНК · восстановление фрагментов эукариотических последовательностей · предсказание эффектов генетических вариантов

Базовая биологическая языковая модель на архитектуре StripedHyena для моделирования и проектирования нуклеотидных последовательностей.

Подходит для: генерация биологических нуклеотидных последовательностей · моделирование прокариотических геномных последовательностей · проектирование последовательностей для молекулярных задач

Сверточная masked language model для восстановления участков ДНК и анализа геномов Arabidopsis thaliana и родственных растений.

Подходит для: восстановление замаскированных нуклеотидов в последовательности ДНК · анализ геномных последовательностей видов Brassicales · оценка вариантов последовательности для исследований геномики

Производная модели LongSafari/hyenadna-medium-450k-seqlen-hf. Геномная авторегрессионная модель HyenaDNA для генерации ДНК и анализа длинных последовательностей на уровне отдельных нуклеотидов.

Подходит для: генерация продолжения последовательности ДНК · дообучение классификатора геномных последовательностей · поиск регуляторных элементов в геноме

ProkBERT-mini-long — геномная модель для восстановления замаскированных k-меров ДНК и анализа микробиомных последовательностей.

Подходит для: восстановление замаскированных участков ДНК · классификация геномных последовательностей · анализ микробиомных последовательностей