DNT-8M-CPL-SMP — компактная трансформерная модель для восстановления замаскированных аллельных состояний и анализа фазы вариантов в диплоидных геномных последовательностях.

Подходит для: восстановление замаскированных пар аллелей в геномном окне · получение представлений диплоидных последовательностей для анализа вариантов · оценка контекста гетерозиготных сайтов и их фазы

Диплоидная модель на 650 млн параметров для получения представлений последовательностей ДНК и анализа вариантов и функциональных геномных элементов.

Подходит для: получение эмбеддингов пар гаплотипов ДНК · оценка инделов ClinVar по эмбеддингам · классификация промоторных последовательностей

Диплоидная masked language model семейства Nucleotide Transformer для восстановления аллельных состояний и анализа фазированных вариантов в последовательностях ДНК.

Подходит для: восстановление замаскированных генотипов в диплоидных участках ДНК · получение представлений фазированных геномных последовательностей · сравнение представлений гетерозиготных участков при смене фазы

Диплоидная геномная masked language model на базе Nucleotide Transformer v3 для восстановления аллельных состояний и анализа последовательностей с учётом фазы.

Подходит для: восстановление замаскированных аллельных пар в геномных окнах · анализ зиготности и дозы аллелей · изучение фазированных вариантов из VCF

Модель восстанавливает замаскированные диплоидные варианты ДНК и строит представления, учитывающие зиготность и фазу.

Подходит для: восстановление замаскированных пар аллелей в последовательности ДНК · анализ фазированных вариантов в локальных геномных окнах · получение представлений диплоидных генотипов для последующего анализа

DNT-8M-MLM — компактный трансформер для восстановления замаскированных аллелей и получения представлений фазированных диплоидных последовательностей ДНК.

Подходит для: восстановление замаскированных аллельных пар в диплоидной последовательности · оценка правдоподобия локальных фазированных геномных окон · получение представлений геномных последовательностей для последующего анализа

Диплоидный геномный энкодер на базе NTv3 для анализа последовательностей и предсказания замаскированных пар аллелей с учётом зиготности и фазы.

Подходит для: восстановление замаскированных аллельных пар в геномных последовательностях · получение контекстных представлений гетерозиготных вариантов · анализ фазированных диплоидных геномных окон

Диплоидная модель Nucleotide Transformer v3 для восстановления замаскированных аллелей и представления локальных геномных последовательностей с учётом фазы.

Подходит для: восстановление замаскированных аллелей в геномном окне · получение представлений диплоидных последовательностей ДНК · анализ зиготности и дозы аллелей